清军脱离接触，向着河口方向撤退。
哪知河口昨夜就被清军所占，清军用缴获的十多艘战船拦腰横截住河口，并以船上配置的虎蹲炮猛烈轰击残存的明军水师战船。
明军大败，本就所剩无几的战船，再度折损过半。见原路返回已不可能，陆秉宣和廖凤二人只得率领残部退往了藤县一带。
告急文书如雪片般飞来，定国担心后路被清军截断，不得不下令全军撤围，退兵回援广西。
随着定国率主力大军从广东返回，明军很快便重新收复了化州、吴川、信宜、石城等城，定国旋即又令义子李远分兵前往收取贺县、平乐。
在拔除了桂林外围的各处据点后，定国于是亲率两万精锐再度向桂林进军。
在凄厉的号角声中，明军将士迈着整齐划一的步伐，浩浩荡荡地向前行进。定国手执梅花枪，端坐于“二斗金”上，冷冷地注视着前方不远处的桂林城，向着众将士大声鼓劲道：“弟兄们，桂林就在眼前，加快行军速度！破城便在今日！”
“诺！”众将士边向着桂林城方向疾行，边齐声虎吼道。
城墙上方巡哨的清军士卒很快就发现了浩浩荡荡杀奔而来的明军，急忙敲打着锣鼓，向城中高声示警道：“明军攻城！明军攻城！”
不到半个时辰，明军弓弩手便率先抵达了桂林城外，他们迅速摆下阵势，张弓搭箭，将大量箭矢倾泻向天空。那些从天而降的箭矢大多落在了城墙之上，守军根本无处可避，中箭者不可计数。
躲在女墙后的清军弓弩手亦不甘示弱，不约而同地举起弓弩，瞄准城外明军，奋起还击。
明军刀盾兵挡在弓弩手身前掩护，尽管大多数箭矢都被盾牌挡住，但还是有少量漏网之鱼，钻进盾牌间的空隙，一旦有人中箭倒下，立刻就有人从后面补上。
就在双方隔着城墙对射的同时，明军主力也已集结完毕，伴随着隆隆战鼓声响起，三千明军精锐携带着攻城扶梯冲出战阵，如潮水般涌向了桂林城。
虽然不少人都倒在了进攻的道路上，但始终没有一个人退缩，大家心里都很清楚，只有用最快的速度冲到城下，才能够躲开守军射来的箭雨。
此战，定国吸取了上次攻打肇庆时扶梯不足的窘境，临出征前就命工匠提前打造了一大批攻城扶梯。当冲到城墙下方后，这些明军将士旋即架起登城扶梯，蚁附攻城。
顷刻间城墙上布满了扶梯，守城清军烧一梯，明军便再架起一梯，推倒一梯，又重新增补一梯。很快就有一名明军士卒率先跃上了城墙，附近的清军见状急忙聚拢上来，举枪便刺，这名刚刚登城的明军士卒在慌乱躲避间，不慎跌落城下，丢了性命。
不一会儿，又有一名明军士卒爬了上来，但见此人一把抱住面前一名清军士卒的后腰，狠狠一个后空摔，便将那人给扔下了城去。
然而他还未来得及在城墙上站稳脚跟，就被三四支长枪同时贯穿了身躯，鲜血内脏瞬间流了一地。
双方激战大半日，城墙上下尸横遍地，血流成河，半凝结的污血顺着城墙砖的缝隙缓缓流淌下来，令人触目惊心。
定国驻马于帅旗之下，眼见前方战事不利，当即对着身旁的传令兵吩咐道：“此仗关系着我军生死存亡，清军已然力竭，熬不了多久了！速速传令下去，继续猛攻！不论付出多少伤亡都必须拿下桂林城！”
桂林守将线国安见形势愈发危急，急忙对着城头上的清军高声大喊道：“传本将军令！杀敌一名赏银五十！若杀敌将校，再赏金百两！”
在线国安重赏的承诺下，清军再度迸发出了强大的战斗力，一连血战了整整七昼夜，明军仍然没能攻下桂林。
定国见迟迟未能取得进展，心中焦虑，遂将中军大营推进至西街古尧山，方便就近指挥。同时命右统军都督王之邦、副将王国仁率部前往西城外铁马柱头开挖地道，打算故技重施，以放迸之法炸塌城墙，迎大军入城。
然而线国安对此早有防备，正当明军将地道挖成，开始往窖室内运送火药的时候，一名奉命潜伏于明军内部的清军死士突然在窑室内吹燃了一枚火折子。
“住手！你是想死不成？快些把火灭掉！”正在窖室内督促众将士填装火药的王国仁陡然见到一丝火光腾起，心中不由大吃一惊，急忙快步冲上前来，伸手就要去抢夺清军死士手中的那枚火折子。
还没等王国仁冲到面前，那名清军死士的脸上忽然露出了一丝诡异的微笑，随即毫不犹豫地把手一松，火折子脱手落地，顷刻间便将整座窖室内的火药全部引燃。
沉闷的爆炸声骤然响起，大地也随之剧烈震颤起来，整个地道瞬间被爆炸完全摧毁，热浪滚滚直冲地道入口，让人根本无法靠近。
尽管爆炸的位置就在桂林西侧城墙正下方，但由于明军火药还没来得及全部填装完毕，加上窖室外的甬道并未封死，爆炸威力大打折扣，除少数裂缝外，并未对桂林城墙的整体结构造成太大的损伤。
定国此时正在中军大帐与诸将议事，突然听见一声沉闷的爆炸声，定国不禁吓了一跳，一种不详的预感顿时蔓延遍全身，声音也随之颤抖起来：“是哪里爆炸了？”
话音未落，就见王之邦跌跌撞撞地从帐外闯了进来，扑通一声跪倒在地，惊魂未定地说道：“元帅，大事不好！地道爆炸了！”